Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.631e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 325.16■■□□□ 1.621e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.621e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-208ENST00000469926 645 ntTSL 323.61■■□□□ 1.371e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 323.56■■□□□ 1.361e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 223.1■■□□□ 1.291e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 C16orf95-202ENST00000562840 1650 ntTSL 220.67■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-222ENST00000497144 598 ntTSL 420.22■□□□□ 0.831e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-215ENST00000493469 579 ntTSL 219.48■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-214ENST00000493290 550 ntTSL 419.48■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 MELTF-204ENST00000469783 806 ntTSL 319.47■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 COL18A1-AS1-202ENST00000485206 2341 ntTSL 1 (best)19.3■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-213ENST00000491069 566 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 RPS6KA2-209ENST00000507371 759 ntTSL 318.92■□□□□ 0.626e-7■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 218.13■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 316.72■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-204ENST00000416579 895 ntTSL 316.49■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TTC6-205ENST00000533625 3567 ntTSL 216.33■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 INPP5A-205ENST00000445580 610 ntTSL 514.86□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TMEM136-201ENST00000314475 1434 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.164e-16■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.264e-16■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-206ENST00000450185 2975 ntTSL 212.73□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-207ENST00000461352 3578 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-211ENST00000474528 4072 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-218ENST00000487508 507 ntTSL 412.27□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-208ENST00000463277 575 ntTSL 412.05□□□□□ -0.481e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-205ENST00000442582 489 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 HECTD4-213ENST00000550968 2313 ntTSL 211.76□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TMEM136-205ENST00000531346 3776 ntTSL 211.55□□□□□ -0.564e-16■■■■■ 38.6
DKC1O60832 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 311.15□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 510.72□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 210.44□□□□□ -0.741e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 210.36□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 FAF1-205ENST00000494400 2127 ntTSL 210.3□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.834e-16■■■■■ 38.6
DKC1O60832 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 SFXN5-209ENST00000464825 532 ntTSL 49.45□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-210ENST00000478801 555 ntTSL 49.28□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 LARS-210ENST00000508667 707 ntTSL 39.09□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 28.9□□□□□ -0.991e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PPARGC1A-204ENST00000506055 2627 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 27.48□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.87□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)6.84□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 LARS-209ENST00000507095 384 ntTSL 36.26□□□□□ -1.411e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.92□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.471e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.611e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-216ENST00000632034 570 ntTSL 24.91□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.57□□□□□ -1.681e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-206ENST00000460873 569 ntTSL 44.38□□□□□ -1.711e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 PON2-203ENST00000446142 1099 ntTSL 1 (best)3.83□□□□□ -1.81e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.076e-8■■■■■ 38.6
DKC1O60832 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 38.5
DKC1O60832 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-16■■■■■ 38.5
DKC1O60832 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-16■■■■■ 38.5
DKC1O60832 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 212.86□□□□□ -0.352e-16■■■■■ 38.5
DKC1O60832 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-16■■■■■ 38.5
DKC1O60832 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.672e-16■■■■■ 38.5
DKC1O60832 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.652e-16■■■■■ 38.5
DKC1O60832 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.181e-75■■■■■ 38.5
DKC1O60832 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.61e-75■■■■■ 38.5
DKC1O60832 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.66e-16■■■■■ 38.4
DKC1O60832 ZNF710-204ENST00000559419 332 ntTSL 318.4■□□□□ 0.546e-16■■■■■ 38.4
DKC1O60832 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.065e-67■■■■■ 38.4
DKC1O60832 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.15e-67■■■■■ 38.4
DKC1O60832 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.335e-67■■■■■ 38.4
DKC1O60832 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.235e-67■■■■■ 38.4
DKC1O60832 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 327.68■■■□□ 2.028e-7■■■■■ 38.4
DKC1O60832 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.948e-7■■■■■ 38.4
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