RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264279.9

NOP58-201, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP58, Length 2,046 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58-201ENST00000264279 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.95■■■□□ 2.54
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NOP58-201ENST00000264279 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NOP58-201ENST00000264279 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.71■■□□□ 1.71
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NOP58-201ENST00000264279 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.45■■□□□ 1.66
NOP58-201ENST00000264279 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.04■■□□□ 1.6
NOP58-201ENST00000264279 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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NOP58-201ENST00000264279 SCRIBQ14160 1630 aa24.66■■□□□ 1.54
NOP58-201ENST00000264279 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.38■■□□□ 1.49
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NOP58-201ENST00000264279 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.25■■□□□ 1.47
NOP58-201ENST00000264279 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
NOP58-201ENST00000264279 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.95■■□□□ 1.42
NOP58-201ENST00000264279 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.93■■□□□ 1.42
NOP58-201ENST00000264279 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NOP58-201ENST00000264279 WIZO95785 1651 aa23.79■■□□□ 1.4
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NOP58-201ENST00000264279 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.37■■□□□ 1.33
NOP58-201ENST00000264279 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
NOP58-201ENST00000264279 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.34■■□□□ 1.33
NOP58-201ENST00000264279 SMARCA2P51531 1590 aa23.33■■□□□ 1.33
NOP58-201ENST00000264279 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.33■■□□□ 1.33
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NOP58-201ENST00000264279 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NOP58-201ENST00000264279 ABCC8Q09428 1581 aa23.02■■□□□ 1.28
NOP58-201ENST00000264279 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.89■■□□□ 1.25
NOP58-201ENST00000264279 NCAPD3P42695 1498 aa22.85■■□□□ 1.25
NOP58-201ENST00000264279 HMGXB3Q12766 1538 aa22.84■■□□□ 1.25
NOP58-201ENST00000264279 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
NOP58-201ENST00000264279 EEA1Q15075 1411 aa22.75■■□□□ 1.23
NOP58-201ENST00000264279 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.75■■□□□ 1.23
NOP58-201ENST00000264279 SOGA1O94964 1423 aa22.73■■□□□ 1.23
NOP58-201ENST00000264279 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NOP58-201ENST00000264279 HRCP23327 699 aa22.69■■□□□ 1.22
NOP58-201ENST00000264279 SYNJ1O43426 1573 aa22.68■■□□□ 1.22
NOP58-201ENST00000264279 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP58-201ENST00000264279 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP58-201ENST00000264279 TOP2BQ02880 1626 aa22.53■■□□□ 1.2
NOP58-201ENST00000264279 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.53■■□□□ 1.2
NOP58-201ENST00000264279 CFTRP13569 1480 aa22.51■■□□□ 1.19
NOP58-201ENST00000264279 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.48■■□□□ 1.19
NOP58-201ENST00000264279 GOLGA3Q08378 1498 aa22.47■■□□□ 1.19
NOP58-201ENST00000264279 CEP162Q5TB80 1403 aa22.45■■□□□ 1.18
NOP58-201ENST00000264279 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.43■■□□□ 1.18
NOP58-201ENST00000264279 KIF21BO75037 1637 aa22.42■■□□□ 1.18
NOP58-201ENST00000264279 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.41■■□□□ 1.18
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NOP58-201ENST00000264279 PRXQ9BXM0 1461 aa22.17■■□□□ 1.14
NOP58-201ENST00000264279 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.17■■□□□ 1.14
NOP58-201ENST00000264279 CLIP1P30622 1438 aa22.15■■□□□ 1.14
NOP58-201ENST00000264279 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NOP58-201ENST00000264279 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.06■■□□□ 1.12
NOP58-201ENST00000264279 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP58-201ENST00000264279 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.02■■□□□ 1.11
NOP58-201ENST00000264279 CUX2O14529 1486 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP58-201ENST00000264279 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.95■■□□□ 1.1
NOP58-201ENST00000264279 NESP48681 1621 aa21.95■■□□□ 1.1
NOP58-201ENST00000264279 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.95■■□□□ 1.1
NOP58-201ENST00000264279 IGF1RP08069 1367 aa21.94■■□□□ 1.1
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NOP58-201ENST00000264279 ARAP1Q96P48 1450 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP58-201ENST00000264279 APLP2Q06481 763 aa21.84■■□□□ 1.09
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NOP58-201ENST00000264279 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NOP58-201ENST00000264279 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.83■■□□□ 1.09
NOP58-201ENST00000264279 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
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NOP58-201ENST00000264279 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.75■■□□□ 1.07
NOP58-201ENST00000264279 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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NOP58-201ENST00000264279 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
NOP58-201ENST00000264279 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NOP58-201ENST00000264279 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.54■■□□□ 1.04
NOP58-201ENST00000264279 MAP3K1Q13233 1512 aa21.54■■□□□ 1.04
NOP58-201ENST00000264279 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP58-201ENST00000264279 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NOP58-201ENST00000264279 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP58-201ENST00000264279 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.5■■□□□ 1.03
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