RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397787.5

COL18A1-AS1-201, COL18A1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COL18A1-AS1, Length 3,425 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.92■■■□□ 2.06
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.15■■□□□ 1.46
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.94■■□□□ 1.42
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.77■■□□□ 1.4
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ABCC9O60706 1549 aa23.05■■□□□ 1.28
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.7■■□□□ 1.22
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.69■■□□□ 1.22
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HRCP23327 699 aa22.58■■□□□ 1.21
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SCRIBQ14160 1630 aa22.54■■□□□ 1.2
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NACADO15069 1562 aa22.29■■□□□ 1.16
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.23■■□□□ 1.15
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.13■■□□□ 1.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.06■■□□□ 1.12
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.93■■□□□ 1.1
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.87■■□□□ 1.09
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.84■■□□□ 1.09
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.73■■□□□ 1.07
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TRIM41Q8WV44 630 aa21.65■■□□□ 1.06
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 WIZO95785 1651 aa21.54■■□□□ 1.04
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.48■■□□□ 1.03
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.37■■□□□ 1.01
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SMARCA4P51532 1647 aa21.33■■□□□ 1.01
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.18■□□□□ 0.98
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.06■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.04■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NEUROD1Q13562 356 aa21.03■□□□□ 0.96
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SMARCA2P51531 1590 aa21.01■□□□□ 0.95
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ABCC8Q09428 1581 aa20.98■□□□□ 0.95
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.77■□□□□ 0.92
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MYT1Q01538 1121 aa20.75■□□□□ 0.91
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SOGA1O94964 1423 aa20.73■□□□□ 0.91
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.71■□□□□ 0.91
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NCAPD3P42695 1498 aa20.68■□□□□ 0.9
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.61■□□□□ 0.89
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HMGXB3Q12766 1538 aa20.53■□□□□ 0.88
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.5■□□□□ 0.87
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 SYNJ1O43426 1573 aa20.48■□□□□ 0.87
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 EEA1Q15075 1411 aa20.42■□□□□ 0.86
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.4■□□□□ 0.86
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.4■□□□□ 0.86
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CEP162Q5TB80 1403 aa20.37■□□□□ 0.85
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CFTRP13569 1480 aa20.36■□□□□ 0.85
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 GOLGA3Q08378 1498 aa20.33■□□□□ 0.84
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.31■□□□□ 0.84
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 APLP2Q06481 763 aa20.3■□□□□ 0.84
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.26■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 NESP48681 1621 aa20.25■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 MIER1Q8N108 512 aa20.24■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CUX1P39880 1505 aa20.24■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TOP2BQ02880 1626 aa20.22■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.21■□□□□ 0.83
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KIF27Q86VH2 1401 aa20.2■□□□□ 0.82
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.19■□□□□ 0.82
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CLIP1P30622 1438 aa20.18■□□□□ 0.82
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CUX2O14529 1486 aa20.16■□□□□ 0.82
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BCANQ96GW7 911 aa20.08■□□□□ 0.81
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.08■□□□□ 0.81
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 P3H3Q8IVL6 736 aa20.05■□□□□ 0.8
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.05■□□□□ 0.8
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.02■□□□□ 0.8
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 KIF21BO75037 1637 aa20■□□□□ 0.79
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.99■□□□□ 0.79
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.98■□□□□ 0.79
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 IGF1RP08069 1367 aa19.98■□□□□ 0.79
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PRXQ9BXM0 1461 aa19.94■□□□□ 0.78
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 TOPBP1Q92547 1522 aa19.92■□□□□ 0.78
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.9■□□□□ 0.78
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.85■□□□□ 0.77
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 ITGAEP38570 1179 aa19.84■□□□□ 0.77
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.84■□□□□ 0.77
COL18A1-AS1-201ENST00000397787 PRDM2Q13029 1718 aa19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms