Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSCO60682 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSCO60682 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSCO60682 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSCO60682 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSCO60682 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSCO60682 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSCO60682 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSCO60682 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSCO60682 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MSCO60682 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSCO60682 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSCO60682 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSCO60682 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSCO60682 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSCO60682 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSCO60682 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSCO60682 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSCO60682 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSCO60682 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSCO60682 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSCO60682 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSCO60682 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms