Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNCRIPO60506 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNCRIPO60506 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms