Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BECN2A8MW95 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BECN2A8MW95 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BECN2A8MW95 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms