Protein–RNA interactions for Protein: A6NIZ1

Ras-related protein Rap-1b-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIZ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A6NIZ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A6NIZ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A6NIZ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A6NIZ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIZ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIZ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIZ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIZ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIZ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIZ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIZ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIZ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIZ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIZ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIZ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIZ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIZ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms