Protein–RNA interactions for Protein: A6NIV6

LRRIQ4, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ4A6NIV6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRIQ4A6NIV6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ4A6NIV6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms