Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC01549A6NIU2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01549A6NIU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01549A6NIU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms