Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UTP11Q9Y3A2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UTP11Q9Y3A2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms