Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP8A1Q9Y2Q0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms