Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4AQ9UPU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4AQ9UPU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms