Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNMA8BQ9ULN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA8BQ9ULN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA8BQ9ULN7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms