Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB23Q9ULC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB23Q9ULC3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms