Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APPL1Q9UKG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APPL1Q9UKG1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms