Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCN11AQ9UI33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCN11AQ9UI33 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN11AQ9UI33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms