Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A6Q9P2U8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms