Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TVP23BQ9NYZ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TVP23BQ9NYZ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms