Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD1Q9NS62 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms