Protein–RNA interactions for Protein: Q9H598

SLC32A1, Vesicular inhibitory amino acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC32A1Q9H598 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC32A1Q9H598 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC32A1Q9H598 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms