Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB1Q9H4B7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB1Q9H4B7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms