Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCBP2Q9H190 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCBP2Q9H190 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDCBP2Q9H190 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCBP2Q9H190 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms