Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP85Q9BW27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms