Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS31

ZNF649, Zinc finger protein 649, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF649Q9BS31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF649Q9BS31 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF649Q9BS31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156 ms