Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLF1Q9BQI6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF1Q9BQI6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms