Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HAPLN3Q96S86 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HAPLN3Q96S86 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HAPLN3Q96S86 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms