Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
LINC00208Q96KT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LINC00208Q96KT6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms