Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RCN3Q96D15 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms