Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC44A1Q8WWI5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms