Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNDC9Q8TBE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC9Q8TBE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms