Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT2Q8N9I0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYT2Q8N9I0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYT2Q8N9I0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms