Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
STRCQ7RTU9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRCQ7RTU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRCQ7RTU9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
STRCQ7RTU9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms