Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRSAM1Q6UWE0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRSAM1Q6UWE0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms