Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSSK4Q6SA08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK4Q6SA08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms