Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC39A4Q6P5W5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC39A4Q6P5W5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms