Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COLEC12Q5KU26 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COLEC12Q5KU26 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms