Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC45A4Q5BKX6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC45A4Q5BKX6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC45A4Q5BKX6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms