Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL39P5Q59GN2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL39P5Q59GN2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms