Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC9B1Q4ZJI4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9B1Q4ZJI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms