Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA3Q16787 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA3Q16787 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMA3Q16787 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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