Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A3Q16572 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A3Q16572 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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