Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SSX2Q16385 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SSX2Q16385 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SSX2Q16385 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX2Q16385 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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SSX2Q16385 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SSX2Q16385 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SSX2Q16385 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SSX2Q16385 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SSX2Q16385 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SSX2Q16385 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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