Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD1Q15797 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD1Q15797 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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