Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SQLEQ14534 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SQLEQ14534 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SQLEQ14534 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms