Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPRIN1Q14444 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPRIN1Q14444 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPRIN1Q14444 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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