Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SHROOM2Q13796 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SHROOM2Q13796 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SHROOM2Q13796 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SHROOM2Q13796 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
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