Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GRIN2AQ12879 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GRIN2AQ12879 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
GRIN2AQ12879 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
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