Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 ECM32YER176W 3366 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 VHC1YBR235W 3363 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 SDA1YGR245C 2304 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 NOP16YER002W 696 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 ARO2YGL148W 1131 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YNR042WYNR042W 429 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 TGS1YPL157W 948 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 SER33YIL074C 1410 nt4.17□□□□□ -1.74
USB1Q12208 IFM1YOL023W 2031 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 RKM2YDR198C 1440 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 GCV1YDR019C 1203 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YGR269WYGR269W 327 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 YMR010WYMR010W 1218 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 CDC28YBR160W 897 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 HRR25YPL204W 1485 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 APC1YNL172W 5247 nt4.16□□□□□ -1.74
USB1Q12208 PUT1YLR142W 1431 nt4.15□□□□□ -1.74
USB1Q12208 KIN28YDL108W 921 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 SCM3YDL139C 672 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 AIR2YDL175C 1035 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 RRP45YDR280W 918 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 AUA1YFL010W-A 285 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 ROT1YMR200W 771 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YNL296WYNL296W 315 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YPL199CYPL199C 723 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 NHP6AYPR052C 282 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 TRE1YPL176C 2352 nt4.15□□□□□ -1.75
USB1Q12208 PRM7YDL039C 2097 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YDL124WYDL124W 939 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 VPS29YHR012W 849 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YNG2YHR090C 849 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MRPL4YLR439W 960 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 TRS33YOR115C 807 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 ORC6YHR118C 1308 nt4.14□□□□□ -1.75
USB1Q12208 PAL1YDR348C 1500 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 COQ4YDR204W 1008 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YER187WYER187W 426 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 JAC1YGL018C 555 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 PEX22YAL055W 543 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MDG1YNL173C 1101 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YHR177WYHR177W 1362 nt4.13□□□□□ -1.75
USB1Q12208 UBP9YER098W 2265 nt4.12□□□□□ -1.75
USB1Q12208 DRN1YGR093W 1524 nt4.12□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YIL028WYIL028W 399 nt4.12□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YJL211CYJL211C 444 nt4.12□□□□□ -1.75
USB1Q12208 RRP3YHR065C 1506 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 KAR2YJL034W 2049 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MRE11YMR224C 2079 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 HST4YDR191W 1113 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YGR153WYGR153W 654 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 PCT1YGR202C 1275 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YHR145CYHR145C 357 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YKL023WYKL023W 834 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 SFK1YKL051W 1062 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MIM2YLR099W-A 264 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YNL228WYNL228W 777 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MAP2YBL091C 1266 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 snR17bsnR17b 332 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MAK3YPR051W 531 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 EMP46YLR080W 1335 nt4.11□□□□□ -1.75
USB1Q12208 BBC1YJL020C 3474 nt4.1□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MAC1YMR021C 1254 nt4.1□□□□□ -1.75
USB1Q12208 TOM40YMR203W 1164 nt4.1□□□□□ -1.75
USB1Q12208 GSP2YOR185C 663 nt4.1□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MDR1YGR100W 2853 nt4.1□□□□□ -1.75
USB1Q12208 BUD7YOR299W 2241 nt4.1□□□□□ -1.75
USB1Q12208 RAD30YDR419W 1899 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 PFK1YGR240C 2964 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 IML2YJL082W 2196 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 TRM8YDL201W 861 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YKL169CYKL169C 384 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YKR104WYKR104W 921 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YML119WYML119W 1074 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 MTF1YMR228W 1026 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 CDC21YOR074C 915 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YPR109WYPR109W 885 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 BSC5YNR069C 1470 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 NOP8YOL144W 1455 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 TDA11YHR159W 1515 nt4.09□□□□□ -1.75
USB1Q12208 YAP1802YGR241C 1707 nt4.09□□□□□ -1.76
USB1Q12208 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MNN1YER001W 2289 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 CLF1YLR117C 2064 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MDM30YLR368W 1797 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 GTR1YML121W 933 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 HOT1YMR172W 2160 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YBR016WYBR016W 387 nt4.08□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 FRS1YLR060W 1788 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YLR125WYLR125W 411 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 YOR292CYOR292C 930 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 PDX3YBR035C 687 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 MEF2YJL102W 2460 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 CDC4YFL009W 2340 nt4.07□□□□□ -1.76
USB1Q12208 SKM1YOL113W 1968 nt4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.1 ms