Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROR1Q01973 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROR1Q01973 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROR1Q01973 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms