Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IP78347 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2IP78347 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms